ניתן להתמחות בשלושה נושאים, המהווים את מושאי ההשפעה המרכזיים בפיתוח הארגוני:

· הארגון- ההשתנות המתמדת והפעולה בסביבה מורכבת (tuna, vuca וכו'), יחד עם לגיטימציה גוברת לביצוע תהליכי למידה מערכתיים של הפיקוד הבכיר של צה"ל, מחייבים את היועץ הארגוני למסוגלות גבוהה בגיבוש אסטרטגיה ארגונית מתמשכת ומבנים ארגוניים חדשים. ראש ההתמחות הינו סא"ל ד"ר רום לירז, רע"ן מלו"פ.

· הקבוצה- מבניית הסגל של הפלוגה בבה"ד ועד לבחינת תהליכי הלמידה והעבודה בפורום מטכ"ל, הקבוצה מהווה מרכיב מרכזי בכלי האבחון וההשפעה של הפיתוח הארגוני. מסלול זה יאפשר הבנת עומק של המרחב הקבוצתי ויקנה הסמכה בהנחיית קבוצות. ראש ההתמחות הינה שרית אלפיה, מפקדת ביסל"ם.

· הפרט- התמחות זו תיפתח במסגרת שנות ההכשרה הבאות.

· מסלול כללי - מיועד לאנשי מיון ומחקר כמסלול כללי ולכל קציני מד"ה אשר טרם החלו בהתמחות. במסגרת המסלול  מוצעים מספר קורסים אשר אינם מהווים חלק מההתמחות.